El Consejo Directivo del ISF tiene como misión acompañar y asesorar al Rector en la toma de decisiones estratégicas para el buen funcionamiento del colegio. Dentro de sus objetivos está velar por una adecuada administración y planificación de todos los estamentos colegiales, como también de los recursos necesarios para dar cumplimiento al Proyecto Educativo Marista del Instituto San Fernando.

Todas las decisiones educativas y administrativas son evaluadas por el Rector y su Consejo Directivo dentro de una estructura orgánica basada en un plan estratégico educativo y guiado por los postulados del Padre Champagnat y la obra marista en nuestra comuna de Colchagua.