El Consejo Directivo del ISF tiene como misión acompañar y asesorar al Rector en la toma de decisiones estratégicas para el buen funcionamiento del colegio. Dentro de sus objetivos está velar por una adecuada administración y planificación de todos los estamentos colegiales, como también de los recursos necesarios para dar cumplimiento al Proyecto Educativo Marista del Instituto San Fernando.

Todas las decisiones educativas y administrativas son evaluadas por el Rector y su Consejo Directivo dentro de una estructura orgánica basada en un plan estratégico educativo y guiado por los postulados del Padre Champagnat y la obra marista en nuestra comuna de Colchagua.

Los integrantes del Consejo Directivo son: 

- Sr. Ismael Valencia León (Rector)
- Sra. Marisol Palacios P. ( Vicerrectora y Directora de Sección  Media)
- Sra. Loreto Zuñiga ( Administradora)
- Srta. Paz Seguel C. ( Directora Sección Inicial)
- Srta. Silenne Gómez M. ( Directora Sección  Básica)
- Sra. Paulina González H. ( Coordinadora Evangelización Explícita)
- Sra. Gabriela Farías y Sr. Juan Basoalto ( Coordinadores Pedagógicos)
- Sra. Karla Binder  ( Encargada de Orientación y Convivencia)